第三次全国经济普查的内容主要包括：单位基本属性、从业人员、财务状况、生产经营情况、生产能力、原材料和能源及主要资源消耗、科技活动情况等。
针对不同的普查对象、不同的信息，采取不同的普查方法。一是全面登记的方法。对法人单位、产业活动单位和个体经营户由其所在地的普查机构负责进行全面登记；二是联网直报与手持PDA采集相结合。对所有普查对象（除军队、武警系统和保密单位外）由普查员使用手持电子终端设备（PDA）进行GPS定位、底册信息核查和相关证照拍摄。联网直报单位普查表通过统一的统计联网直报平台布置给企业填报，非联网直报单位和个体经营户普查表使用手持电子终端设备采集数据；三是普查与抽样调查相结合。为取得个体经营户的经营数据，普查登记后抽取一定比例的个体经营户由国家统计局调查队进行配套抽样调查。 （记者 周丛笑）
